今日，Intel、聯(lián)想以及華大基因今天宣布，三家公司正攜手加快COVID-19新型冠狀病毒的基因組特性分析。
據(jù)悉，來自Intel及聯(lián)想的專業(yè)技術(shù)與生命科學(xué)專家將通力合作，為華大基因的研究人員提供全新的大數(shù)據(jù)分析技術(shù)和計(jì)算資源，進(jìn)一步提升其基因測序工具的分析能力，更高效地研究新型冠狀病毒的基因組特性。
Intel和聯(lián)想攜手為華大基因提供的技術(shù)包括一個(gè)大型高性能計(jì)算集群，可用于處理從華大DNBSEQ-T7 測序系統(tǒng)讀取的高通量數(shù)據(jù)。
華大基因的研究人員將能夠通過全新的高性能計(jì)算和基因組分析技術(shù)，以及Intel和聯(lián)想的相關(guān)資源和專業(yè)知識，進(jìn)一步加速他們對新型冠狀病毒的基因組特性研究。
該技術(shù)將支持科學(xué)家研究病毒的毒性、傳播模式、病原體與宿主間的相互作用，進(jìn)而助力流行病學(xué)及疫苗設(shè)計(jì)研究。這些工作對于未來創(chuàng)建更好的診斷方法和設(shè)計(jì)有效的疫苗或其他保護(hù)性措施(例如免疫療法)是非常必要的。
通過這項(xiàng)合作，華大基因?qū)⒌靡岳^續(xù)優(yōu)化其新型冠狀病毒檢測試劑盒并獲取大量有價(jià)值的信息。這些信息將有助于確定將來開發(fā)有效疫苗或治療方法的潛在靶標(biāo)。
通過Intel和聯(lián)想的共同努力，聯(lián)想的超算技術(shù)支持并優(yōu)化了“基因組優(yōu)化和可擴(kuò)展性工具”，(簡稱GOAST，首個(gè)獲得Intel精選解決方案驗(yàn)證的基因組分析工具)，可為全基因組測序和全外顯子測序的計(jì)算提供高達(dá)40倍的加速，助力華大基因優(yōu)化計(jì)算過程，高效處理數(shù)據(jù)，更快地生成可靠的基因組分析成果，從而縮短科研和臨床觀察的時(shí)間。
“目前我們對這個(gè)新型冠狀病毒還有很多不了解的地方。華大基因通過分析病毒基因組數(shù)據(jù)，加速對感染者的快速識別和基因組特性的研究，而這些工作需要投入巨大的計(jì)算資源，這恰恰是我們可以發(fā)揮作用的地方。”
Intel公司市場營銷集團(tuán)副總裁兼中國區(qū)總經(jīng)理王銳表示，“因此，我們緊密攜手，為正在防疫一線進(jìn)行病毒研究的科學(xué)家提供更多的計(jì)算資源和專業(yè)支持，希望與狡猾的病毒賽跑，助力疫情防控，拯救更多生命。”
據(jù)了解，在基因測序工作中，每毫升體液通常會(huì)包含數(shù)百萬個(gè)不同的病毒體，而每個(gè)病毒體的基因組則包含大約30,000個(gè)DNA堿基或字母。
華大基因正在對許多感染患者和疑似感染患者的微生物進(jìn)行基因測序，因此這些研究工作將會(huì)生成TB級乃至PB級的海量數(shù)據(jù)。要想高效地快速處理這些重要數(shù)據(jù)，就需要采用更為先進(jìn)的HPC基礎(chǔ)架構(gòu)、計(jì)算技術(shù)以及優(yōu)化的基因組分析方法。
