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國(guó)家基因庫(kù)投入運(yùn)營(yíng):全球最大,采用阿里云技術(shù)

   時(shí)間:2016-09-23 17:10:25 來(lái)源:互聯(lián)網(wǎng)編輯:星輝 發(fā)表評(píng)論無(wú)障礙通道

9月22日,位于深圳大鵬新區(qū)的中國(guó)首個(gè)、全球第四個(gè)國(guó)家級(jí)基因庫(kù)正式投入運(yùn)營(yíng)。國(guó)家基因庫(kù)是全世界最大的綜合性基因庫(kù),1期建成后,綜合能力世界第一。

這里既有保存動(dòng)植物、微生物和人類(lèi)組織細(xì)胞等樣本的“濕庫(kù)”,也有匯集各種生物信息的“干庫(kù)”——數(shù)據(jù)中心。為了確保“干庫(kù)”具備優(yōu)良的數(shù)據(jù)吞吐能力和足夠安全可靠,國(guó)家基因庫(kù)運(yùn)營(yíng)方華大基因同阿里云達(dá)成戰(zhàn)略合作,基于阿里云飛天操作系統(tǒng)構(gòu)建了基因檢測(cè)大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),解決了生物大數(shù)據(jù)高性能計(jì)算難題。

國(guó)家基因庫(kù)執(zhí)行主任、華大基因研究院院長(zhǎng)徐訊介紹說(shuō):“我們希望打造中國(guó)乃至世界最大的生物信息數(shù)據(jù)中心,像是生命健康數(shù)據(jù)領(lǐng)域的谷歌。”記者在現(xiàn)場(chǎng)看到,基因庫(kù)內(nèi)擺放的多臺(tái)基因測(cè)序儀正不停的運(yùn)轉(zhuǎn)。它們每天都產(chǎn)生著大量的基因數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)被傳輸?shù)綌?shù)據(jù)中心,并面向全球的科研機(jī)構(gòu)和企業(yè)開(kāi)放。

據(jù)了解,國(guó)家基因庫(kù)已實(shí)現(xiàn)對(duì)基因信息數(shù)據(jù)總量達(dá)20PB的訪問(wèn)支持。20PB是什么概念?以一部電影500MB計(jì)算,20PB(1TB=1024GB,1PB=1024TB)相當(dāng)于4千萬(wàn)部電影,一個(gè)人一天看一部電影需要10萬(wàn)年才能看完。

國(guó)家基因庫(kù)是真正的‘國(guó)庫(kù)’,比銀行的金庫(kù)還要寶貴。因此,技術(shù)是否自主可控、是否足夠安全,也成為運(yùn)營(yíng)方衡量的標(biāo)準(zhǔn)。阿里云的飛天系統(tǒng),由阿里巴巴的工程師自主研發(fā),能夠?qū)⒊汕先f(wàn)臺(tái)機(jī)器變成一臺(tái)超級(jí)計(jì)算機(jī),在存儲(chǔ)和計(jì)算性能上遠(yuǎn)超國(guó)外技術(shù)。同時(shí),具備支付寶、淘寶同量級(jí)的安全防御能力。

徐訊說(shuō),在農(nóng)業(yè)時(shí)代,一個(gè)國(guó)家擁有的耕地越多優(yōu)勢(shì)越大;在工業(yè)時(shí)代,擁有的石油、礦產(chǎn)等能源越多優(yōu)勢(shì)越大;而在生命時(shí)代,擁有更多的基因資源同時(shí)能對(duì)基因資源進(jìn)行認(rèn)知和利用,則意味著更大的優(yōu)勢(shì)。

在國(guó)家基因庫(kù)建成前,我國(guó)每年產(chǎn)出的大量基因數(shù)據(jù)都存在國(guó)際三大數(shù)據(jù)庫(kù)——NCBI、EBI、DDBJ中,在基因數(shù)據(jù)已成為戰(zhàn)略資源的現(xiàn)在,國(guó)內(nèi)不能保存我國(guó)獨(dú)特的基因數(shù)據(jù),這本身就是一種風(fēng)險(xiǎn)。

阿里云的計(jì)算能力還將為科學(xué)家解讀生命密碼提供幫助。徐訊說(shuō),“我們每個(gè)人大約有3個(gè)GB的基因組大小,但是我們真正能讀得懂的區(qū)域只有1%的區(qū)域,99%的區(qū)域我們是不理解的。”

基因庫(kù)的建立將推動(dòng)基因的進(jìn)一步解讀和利用。“怎么樣能理解更多呢?就像我們做人工智能研究一樣,機(jī)器要想學(xué)會(huì)下棋就需要看上萬(wàn)部的棋譜。這個(gè)也是一樣的,要看懂人類(lèi)基因組上的未知區(qū)域就必須依賴(lài)更多的數(shù)據(jù),增加10%的理解至少需要一百萬(wàn)到一千萬(wàn)新增人的數(shù)據(jù)。所以,只有大量提供數(shù)據(jù)才能產(chǎn)生出新的理解,而產(chǎn)生出新的理解之后測(cè)序的價(jià)值就會(huì)更大。”

基因與云計(jì)算的結(jié)合已成為一種趨勢(shì)。即將開(kāi)幕的全球云計(jì)算頂級(jí)會(huì)議——2016杭州·云棲大會(huì)上,更是單獨(dú)為基因計(jì)算設(shè)置了專(zhuān)場(chǎng)討論,引發(fā)關(guān)注。

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